疱疹性咽炎季节性比较明显，大多见于夏初流行，冬春亦有。病程为7~10天，传染性较大，常可在托儿所、幼儿园形成小范围的流行。由于疱疹性咽炎患儿的疱疹多集中在咽后壁，所以患儿咽部疼痛比较明显，特别是在疱疹破溃变成溃疡后，更是连吞口水都感觉到疼痛，所以患儿多出现厌食现象。患儿还会出现突然呕吐、高热的现象。严重者可引起气管炎、肺炎、喉炎等。
小儿疱疹性咽峡炎如单独发生，常无全身症状。咽部疼痛，影响吞咽。婴幼儿患病，常表现为进食时哭吵，不愿进食，颌下淋巴结肿大有压痛，有时伴有发热。咽部疱疹多发生于软腭悬雍垂和舌腭弓等处，呈线状分布。开始为小疱，但很快破裂，所以通常看不到疱疹，而见到强烈遗疡。表面覆有淡黄色或白色假膜，周围粘膜呈鲜红色充血。
此外宝宝的呼吸道屏障功能不足，也是宝宝患病的重要原因。宝宝的呼吸道粘膜柔嫩，容易受到各种刺激（寒冷、刺激性气体等）而发生充血、肿胀甚至炎症反应。呼吸道表面有一种带无数纤毛的细胞，这些纤毛好像一把大扫除的刷子一样，不断吸入并粘附在呼吸道上的小颗粒如粉尘、病菌等向外清扫，排到喉头咳出，但小儿呼吸道上的这种纤毛活动比较微弱，因此“自洁”功能也就相对地差。人在生活中是要不断地呼吸以维持生命的，这样每天随吸气进入呼吸道的细菌、病毒、有害气体、粉尘等，不可胜数，加上上述小儿呼吸道种种防御功能的不足，所以很容易发生各种急性呼吸道感染。
